Спустя 31 год после катастрофических событий, связанных с Третьей мировой войной и ядерным ударом по столице Японии, был возведён новый мегаполис – Нью-Токио. Внешний лоск скрывает за собой мрачную реальность: государственный аппарат жестоко подавляет любую попытку сопротивления. Власть опирается на идеологию, напоминающую фашистские режимы, и использует все доступные средства для контроля над населением. Исследовательские центры становятся ареной жутких парапсихологических экспериментов, где люди подвергаются манипуляциям с целью создания идеального оружия, способного сломить любые угрозы.
В этой напряжённой обстановке полковник Сикисима, возглавляющий биологические военные проекты, вступает в открытый конфликт с правительственными структурами, которые ставят свои интересы выше гуманности. Тем временем в обществе зарождается культ, поклоняющийся загадочной сущности по имени Акира. Сторонники этой фигуры верят, что его возвращение способно спасти страну от надвигающегося хаоса и разрушения. Противостояние идеологий, страстное стремление к власти и поиск надежды необычайно накаляют атмосферу, ставя на карту будущее нации.